Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PcnaP17918 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PcnaP17918 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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