Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrphP15331 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrphP15331 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrphP15331 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrphP15331 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrphP15331 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrphP15331 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrphP15331 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrphP15331 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrphP15331 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PrphP15331 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms