Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rb1P13405 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rb1P13405 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms