Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb1P12658 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms