Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DmdP11531 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DmdP11531 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DmdP11531 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DmdP11531 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DmdP11531 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DmdP11531 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DmdP11531 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DmdP11531 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DmdP11531 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DmdP11531 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms