Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Schip1P0DPB4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms