Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Amd1P0DMN7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms