Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Spta1P08032 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spta1P08032 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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