Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gap43P06837 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gap43P06837 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms