Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa4P06798 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms