Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myl1P05977 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms