Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XlrP05531 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XlrP05531 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XlrP05531 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XlrP05531 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
XlrP05531 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
XlrP05531 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
XlrP05531 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
XlrP05531 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XlrP05531 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
XlrP05531 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XlrP05531 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms