Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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H2-Eb1P04230 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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H2-Eb1P04230 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Eb1P04230 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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H2-Eb1P04230 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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H2-Eb1P04230 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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H2-Eb1P04230 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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H2-Eb1P04230 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Eb1P04230 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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