Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04214 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04214 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04214 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04214 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04214 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04214 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04214 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04214 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04214 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms