Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tk1P04184 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms