Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01878 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01878 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01878 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01878 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01878 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01878 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01878 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01878 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01878 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01878 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01878 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms