Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hcn3O88705 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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