Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hcn1O88704 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms