Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BlmO88700 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BlmO88700 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BlmO88700 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BlmO88700 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BlmO88700 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BlmO88700 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BlmO88700 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BlmO88700 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BlmO88700 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BlmO88700 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BlmO88700 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BlmO88700 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms