Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mmp23O88676 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp23O88676 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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