Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms