Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan6O70401 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms