Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldb2O55203 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms