Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aff2O55112 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aff2O55112 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms