Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr1O55100 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms