Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Copb2O55029 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms