Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limk2O54785 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limk2O54785 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limk2O54785 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms