Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srpk2O54781 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srpk2O54781 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srpk2O54781 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srpk2O54781 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms