Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1baO35930 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1baO35930 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms