Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd2O35927 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnd2O35927 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms