Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms