Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1mwO35599 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1mwO35599 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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