Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6aO35464 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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