Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xbp1O35426 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms