Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-ObO35424 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms