Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NmiO35309 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NmiO35309 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NmiO35309 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NmiO35309 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NmiO35309 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms