Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe40O35185 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe40O35185 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms