Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smad6O35182 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms