Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pitx3O35160 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms