Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm2O09102 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm2O09102 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm2O09102 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm2O09102 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm2O09102 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm2O09102 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm2O09102 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm2O09102 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm2O09102 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm2O09102 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms