Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eftud2O08810 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms