Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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MsmbO08540 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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