Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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