Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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