Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21797J3QNW5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms