Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top6blJ3QMY9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms