Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20828J3KMI7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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