Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Taf4bG5E8Z2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Taf4bG5E8Z2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Taf4bG5E8Z2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Taf4bG5E8Z2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Taf4bG5E8Z2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Taf4bG5E8Z2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf4bG5E8Z2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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