Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfip1G5E8V9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arfip1G5E8V9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms