Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm3371F7CQW8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm3371F7CQW8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm3371F7CQW8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm3371F7CQW8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3371F7CQW8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms